巨龟之所以常在古井中被发现，是因为在中国传统文化中，古井一般都是由石灰岩等物质形成的天然地下水源，其水质比较清澈、饮用安全，同时井口下部多有淤泥或泥沙沉积，成为了巨龟倚靠和栖息的理想场所。

此外，巨龟在生态环境中通常是属于慢性动物，它们寿命长、个头大、体型壮观，同时受到了人类的崇拜和畏惧。在古代，一些寺庙、宫殿、园林等地方都会人工挖掘井水作为供水来源，并养着一些巨龟，供人们观赏抚摸。这些巨龟在井水中长期生活，因为食量小且寿命长，所以慢慢地成为了井水中的“珍品”。到了现代，在城市化建设的过程中，一些老旧的井随着时间的退化而不再使用，巨龟就会在漫长的时间里，越来越尽情地栖息在井底，直到被人们发现。

总的来说，巨龟在古井中被发现是由于自然和人文因素的共同影响，既介于生物学和文化学之间，也是历史和传统的见证者。