在鼬的初始设定中，他作为一个身处宇智波一族的年轻忍者，行为表现得狂傲不羁，与身为族长的父亲貌合神离。他挑衅族中的高层，甚至公开放言“我对这一族的气量绝望了！”并把苦无钉在族徽上表达自己的愤懑。然而，这种行为与他在木叶村的任务产生了明显的矛盾。作为被派到木叶的间谍，他应该隐藏自己的真实情感和意图，而不是如此激烈地表现出对族人的不满和失望。

此外，鼬在族人中表现出异常的行为，可能也暗示着他被木叶村策反的情节。然而，如果考虑到宇智波一族准备反叛的事实，这种行为就显得非常不合逻辑。宇智波一族正在策划一场针对木叶村的重大叛变，而作为间谍的鼬却突然与父亲疏远了、甚至决裂了，性格一反平常。这显然是一个重大的逻辑问题，表明鼬的行为和宇智波一族的叛变计划之间存在某种矛盾。

另一个重要的问题是关于鼬获得万花筒写轮眼的条件。岸本通过鼬之口给出了提示：万花筒写轮眼的获得需要杀死最亲近的朋友。然而，在故事后期，岸本为了给鼬洗白，主动废弃了这个设定，改为“只要目击了亲近之人的死亡，或者受到强烈的精神刺激都可以开眼”。这种改变不仅破坏了故事的文学性，也使得鼬的角色变得不可信。如果万花筒写轮眼的获得不需要杀死最亲近的朋友，那么鼬杀死止水的行为就显得毫无意义。我更倾向于鼬和佐助之战中，鼬给佐助看的挖眼桥段才是最初的设定。

关于鼬灭族的问题，也是故事中最大的逻辑问题之一。宇智波一族的反叛并没有达到需要灭族的地步。木叶村完全有能力控制住局势，而不是采取大规模杀戮的手段。即使是为了保护木叶村，灭族的行为也过于极端和不合理。如果鼬真的是为了保护木叶村而行动，他应该寻求更合理的解决方案，而不是采取如此极端的手段。

同时，鼬寻求带土的帮助也存在逻辑问题。灭族是两顾问+团藏的共同决定，三代虽然无可奈何但是也默许了。但是只委派鼬一个人去进行灭族计划实在太大胆了，因为鼬当时实力再强，也只是个13岁的孩子，一旦行动失败——哪怕宇智波一族在那个夜晚有一个精英忍者没睡好失眠了，发出求救信号，被惊扰的宇智波一族肯定会立即反叛，最坏的结果（木叶动乱）就会发生。

如果我是团藏，我一定会让鼬至少带领”根“的武装力量去灭族。虽然岸本之后也发现了这一点不合理，改为由带土协助鼬，但这就更加成问题了：鼬为了保护木叶，在木叶高层的指示下去灭族，却在不告知高层的情况下偷偷跑去与一个隐藏在暗处、想要摧毁木叶的S级罪犯”宇智波斑“合作？这是什么脑回路？当时带土已经引发了九尾之乱、杀死了四代夫妇，这样一个危险的大反派，鼬居然只是口头约定”你不许进攻村子“就放心合作了？

而且鼬发现了九尾之乱始作俑者（也就是带土，但他以为是宇智波斑）的身份之后竟然没有告知三代等人，以至于三代对于这位曾经差点血洗村子的大BOSS的身份毫不知情，也没有立即制定相应的计划。

鼬作为间谍的身份与他的一些行为产生了矛盾。他的一些行动，如用月读折磨卡卡西，虽然鬼鲛在一旁，但是月读幻境的内容是完全由他控制的，完全可以在月读里把情报传给卡卡西，以卡卡西的智商，配合鼬演一出戏，还不是简简单单的事？

放倒卡卡西之后更是指令鬼鲛带走卡卡西、杀死阿斯玛和红，这些行为似乎并不符合他作为木叶间谍的立场。这些行动更像是为了自己的目的而进行的，而不是为了保护木叶。如果他是木叶的间谍，那么他应该以木叶的利益为重，而不是以自己的私人目的为重。鼬不知道上忍是有多么稀缺吗，一下弄死一个特别上忍和两个精英上忍，对木叶多大损失?假如凯没及时赶到的话，这一切就可能已经发生了。

关于鼬虐待自己的弟弟佐助的问题，也存在一些争议。虽然鼬可能是为了训练佐助和提高他的实力而这么做，但这并不能解释他为什么要对佐助进行精神肉体上的虐待。这样的行为并不符合一个好哥哥的形象。鼬就不怕玩脱了了，佐助精神崩溃报废了吗？而作为反派这样折磨佐助，就合情合理了。

也许岸本最初设定是鼬是一个鼬故事的反派，后来因为人气太高，前期的模棱两可的设定，就可打打补丁补上 了。